|
|
|
|
Beschreibung |
KursbeschreibungZeitgemäße Biologie und Biochemie sind ohne den Einsatz informatischer Methoden undenkbar geworden. Die Bioinformatik ist der Teil der Computerwissenschaft, der Datenbanken, Algorithmen und Werkzeuge für diese Anwendungen konzipiert und umsetzt. Aufgrund der speziellen Anforderungen, die sich aus der Natur der biologischen Objekte ergeben, hat die Bioinformatik spezielle Verfahren entwickelt, die in keinem anderen Teilgebiet der Informatik ähnliche Bedeutung haben und gesondert bearbeitet werden müssen.
Dieser Kurs bietet eine Einführung in die wichtigsten Modelle und Algorithmen der Bioinformatik. Schwerpunkte setzen Methoden des Sequenzvergleichs (dynamisches Programmieren) und Verfahren zur Charakterisierung von Proteinfamilien (Hidden-Markov-Modelle). Daneben werden Algorithmen zur Vorhersage der Proteinsekundär- und RNA-Sekundärstruktur vorgestellt und es wird das Berechnen von Stammbäumen erläutert. Eingegangen wird auch auf die Analyse von Datensätzen aus Genomics-, Transkriptomics- und Proteomics-Experimenten sowie auf die wichtigsten bioinformatischen Datenbanken. Der Kurs ist in sich geschlossen; er vermittelt die für das Verständnis erforderlichen statistischen und biologischen Grundlagen und bietet eine Einführung in neuronale Netze und Support-Vektor Maschinen.
Basistext ist das Buch: R. Merkl, Bioinformatik, 3. Auflage 2015 aus dem Verlag WILEY-VCH.
|
|
|
